Verschillende toepassingen vereisen verschillende soorten houtmodificatoren; daarom moet bij de keuze van de modifier rekening worden gehouden met de beoogde gebruiksomgeving. Voor hout dat bedoeld is voor langdurig gebruik buiten-, moet prioriteit worden gegeven aan producten die superieure weerstand bieden tegen bederf, water en weersinvloeden. Omgekeerd moet bij de meubelproductie de nadruk worden gelegd op milieuveiligheid en lage-geureigenschappen.
Er moet ook rekening worden gehouden met de specifieke houtsoort. Variaties in dichtheid, vochtgehalte en celstructuur tussen verschillende houtsoorten beïnvloeden hoe goed een modificator het materiaal binnendringt. Houtmodificatoren van hoge-kwaliteit bieden doorgaans voordelen zoals snelle penetratie, goede stabiliteit en gebruiksgemak, die allemaal de productie-efficiëntie helpen verbeteren.
